Highschool of the Dead se odehrává v dnešním Japonsku, počínaje tím, jak je planeta zasažena smrtelnou pandemií, která proměňuje lidi v zombie, eufemisticky označované jako „Them“ (?? Yatsura?).
Děj sleduje řadu studentů středních škol (stejně jako vysokoškolskou zdravotní sestru), kteří se vyrovnávají s celosvětovou katastrofickou událostí nazvanou „Vypuknutí“. Rovněž musí čelit dalším rizikům sociálního pádu v podobě nebezpečných přeživších a možnému úpadku jejich konkrétních morálních kodexů, když se herci pokoušejí přežít zombie apokalypsu. Počínaje HS žáci útěk do města v místě, kde se musí vyrovnat s jeho žáky a zkaženým učitelem. Dostanou psa i malou holčičku a hodnotí přeživší ve svých domech. Poté se konečně dostanou do základní školy, která je údajně bezpečnou zónou, projdou policejní stanicí a naposledy v nákupním centru.
